id C-RSI_count C-RRI_count C-RSI_rpm C-RRI_rpm log2(FC) Pvalue FDR significant source_gene chr strand genomic_start genomic_end spliced_length annot_type ghi_circ_000009 41.66666667 12 0.65138936 0.185187302 -1.814534973 0.000143817 0.004649912 yes Gh_A01G0389 A01 - 5987406 5992144 4739 antisense ghi_circ_000021 3 0.333333333 0.03617034 0.003951925 -3.194179535 0.022133319 0.21753943 no Gh_A01G1833 A01 + 98159661 98165863 6125 exon_intron ghi_circ_000022 3 0.333333333 0.022276628 0.002469449 -3.173269585 0.021588993 0.21753943 no Gh_A01G1833 A01 - 98165480 98175281 9802 antisense ghi_circ_000023 8 3 0.060508572 0.022500033 -1.427212418 0.047640909 0.350581006 no Gh_A01G1834 A01 - 98166203 98176004 9802 antisense ghi_circ_000030 6 1.666666667 0.02201742 0.006135652 -1.843356988 0.032917351 0.280866226 no NA A02 - 612962 633234 20273 intergenic ghi_circ_000031 5.333333333 1.333333333 0.073384559 0.018501872 -1.987805258 0.027631426 0.248682834 no Gh_A02G0092 A02 - 848594 853870 5277 exon_intron ghi_circ_000034 3.666666667 53.66666667 0.029126847 0.423484645 3.861888203 4.83E-23 1.59E-20 yes Gh_A02G0219 A02 + 2526477 2535727 9251 intronic ghi_circ_000057 19 9 0.052896427 0.024751226 -1.095670321 0.036086376 0.289131082 no NA A03 - 83644111 83670549 26439 intergenic ghi_circ_000068 0.666666667 4.333333333 0.004984835 0.033096104 2.731043601 0.02638883 0.240798074 no NA A03 + 96146330 96155906 9577 intergenic ghi_circ_000072 11 1.666666667 0.011724536 0.001822589 -2.685469559 0.000110171 0.004021259 yes Gh_A04G0169 A04 + 3037783 3106030 68248 exon_intron ghi_circ_000076 3 18.33333333 0.018337231 0.1111759 2.599996367 2.12E-07 1.55E-05 yes Gh_A04G0224 A04 - 4552177 4564173 11997 intronic ghi_circ_000077 3.333333333 15 0.008053813 0.036412423 2.17668683 0.000148627 0.004649912 yes Gh_A04G0224 A04 - 4552177 4582447 30258 exon_intron ghi_circ_000083 2.333333333 0 0.002051452 0.001 -1.036645473 0.015680787 0.194382587 no NA A04 + 7439068 7522194 83127 intergenic ghi_circ_000085 3.666666667 0.666666667 0.727267658 0.133380302 -2.446940803 0.031326982 0.270836742 no NA A04 + 7893391 7893756 366 intergenic ghi_circ_000097 6.666666667 0 0.006831681 0.001 -2.772240687 0.000107349 0.004021259 yes Gh_A05G2112 A05 - 23947676 24019595 71920 intronic ghi_circ_000112 5.333333333 0 0.057507232 0.001 -5.845671492 0.001964269 0.039182899 yes Gh_A05G3458 A05 + 89898212 89907913 6653 exon_intron ghi_circ_000115 14.66666667 6 0.133230158 0.05538108 -1.266455591 0.018514398 0.205563491 no Gh_A05G3458 A05 + 89900135 89910558 8064 exon_intron ghi_circ_000124 2 6.333333333 0.004931777 0.01569619 1.670235072 0.021755915 0.21753943 no Gh_A05G3468 A05 + 90140742 90170843 29738 exon_intron ghi_circ_000136 5 0.666666667 0.021610731 0.002851401 -2.922005003 0.010373325 0.133632838 no NA A06 - 98399697 98416674 16978 intergenic ghi_circ_000140 2 8.666666667 0.604949971 2.620299195 2.11484381 0.008522018 0.116421532 no Gh_A06G1591 A06 + 100542792 100543036 245 intronic ghi_circ_000185 9.666666667 1 0.067891895 0.006848436 -3.309392884 2.44E-05 0.001003231 yes Gh_A08G1957 A08 + 100650750 100661196 10447 antisense ghi_circ_000196 5 1.333333333 0.06442419 0.017274308 -1.898974541 0.031273991 0.270836742 no Gh_A09G1053 A09 + 60889925 60897659 5714 exon_intron ghi_circ_000197 42.66666667 20.66666667 0.628267985 0.301960863 -1.057018488 0.000781534 0.019748769 yes Gh_A09G1053 A09 + 60890862 60898739 4992 exon_intron ghi_circ_000211 0 2.666666667 0.001 0.014806334 3.888142622 0.007849707 0.112114296 no Gh_A10G0192 A10 - 1683642 1696702 13061 exon_intron ghi_circ_000219 0.666666667 5.333333333 0.001342907 0.010409753 2.954504112 0.004437714 0.066926621 no Gh_A10G1106 A10 - 54644339 54681106 36768 antisense ghi_circ_000234 1.333333333 6.666666667 0.007924054 0.038211636 2.269701449 0.03370815 0.281153619 no Gh_A10G1948 A10 - 96951121 96963593 12473 antisense ghi_circ_000236 7.666666667 21.66666667 0.035725244 0.100813248 1.496669461 2.31E-05 0.001003231 yes Gh_A10G2024 A10 + 98027902 98043567 15666 exon_intron ghi_circ_000237 2 6.666666667 0.004168978 0.013990105 1.746641255 0.010954997 0.138412174 no Gh_A10G2024 A10 + 98045797 98087691 34807 exon_intron ghi_circ_000238 1 7.333333333 0.00121302 0.008748378 2.850412071 0.000724628 0.019043231 yes Gh_A10G2025 A10 + 98045797 98111317 61732 exon_intron ghi_circ_000239 10 25 0.021240957 0.052718763 1.311467773 0.002601069 0.048825777 yes Gh_A10G2025 A10 + 98054335 98089673 34150 exon_intron ghi_circ_000240 22 57.33333333 0.083821715 0.217836666 1.377850852 1.53E-08 1.44E-06 yes Gh_A10G2025 A10 + 98087254 98109696 19266 exon_intron ghi_circ_000248 0.333333333 5 0.001820436 0.026317381 3.853659617 0.001056416 0.025706114 yes NA A10 + 99474267 99488277 14011 intergenic ghi_circ_000267 20 8.333333333 0.039542941 0.016567338 -1.255078343 0.008705065 0.116421532 no NA A11 - 85269389 85306547 37159 intergenic ghi_circ_000268 2.666666667 8 0.006144649 0.018402171 1.582473486 0.008640084 0.116421532 no NA A11 - 85338786 85370450 31665 intergenic ghi_circ_000274 0 5.666666667 0.001 0.016039652 4.003570901 0.000127331 0.00440298 yes Gh_A11G2684 A11 + 89234996 89261617 26258 exon_intron ghi_circ_000292 4 0.666666667 0.031745141 0.005066902 -2.647359859 0.023528317 0.224030497 no Gh_A12G0465 A12 - 10013350 10024095 9343 exon_intron ghi_circ_000300 38.66666667 15.33333333 8.505060937 3.333335295 -1.351355129 0.003286143 0.056815674 no NA A12 + 85186316 85186646 331 intergenic ghi_circ_000308 17.66666667 35.66666667 0.013148819 0.026553987 1.013995238 0.002862399 0.052238785 no NA A13 + 4227265 4326083 98819 intergenic ghi_circ_000309 1.333333333 5.333333333 0.005707267 0.022922331 2.005881713 0.017804253 0.204430295 no NA A13 + 4227727 4244757 17031 intergenic ghi_circ_000310 4 0 0.092063312 0.001 -6.524554447 0.004204482 0.065770108 no Gh_A13G0337 A13 + 4332165 4335439 3172 exon_intron ghi_circ_000322 3 0 0.327368693 0.001 -8.35477255 0.003930181 0.062978755 no Gh_A13G0974 A13 - 52699572 52701014 672 exon_intron ghi_circ_000328 4.666666667 19.66666667 0.014638136 0.062204754 2.087293039 1.73E-06 0.00010339 yes Gh_A13G1798 A13 - 77382843 77407215 23076 exon_intron ghi_circ_000335 0 2.333333333 0.001 0.004371128 2.128005541 0.035613429 0.288864482 no Gh_D01G0260 D01 + 2339748 2423517 37876 exon_intron ghi_circ_000336 14.33333333 6 0.023506465 0.009749517 -1.269654949 0.023984255 0.225109363 no Gh_D01G0335 D01 - 3602882 3648040 45159 antisense ghi_circ_000339 194.3333333 21.33333333 0.647517145 0.070318894 -3.202934113 9.69E-36 6.36E-33 yes Gh_D01G0522 D01 - 6430125 6452209 22085 exon_intron ghi_circ_000361 2 6.666666667 0.001884196 0.006152977 1.707335606 0.01676214 0.200231377 no Gh_D02G0131 D02 - 1080914 1162125 78661 exon_intron ghi_circ_000363 4.333333333 0.333333333 0.028861473 0.002290232 -3.655579063 0.008860086 0.116421532 no Gh_D02G0236 D02 + 2769345 2780558 11214 exon_intron ghi_circ_000372 2 35.66666667 0.004252296 0.076085422 4.161306085 1.43E-18 3.13E-16 yes Gh_D02G0719 D02 + 10540339 10574463 34125 exon_intron ghi_circ_000373 2 32 0.004252296 0.068172531 4.00287656 4.24E-16 6.97E-14 yes Gh_D02G0719 D02 + 10540366 10574490 34125 exon_intron ghi_circ_000402 6.666666667 24.33333333 0.028088308 0.102822009 1.872107488 5.19E-06 0.000262468 yes Gh_D03G1606 D03 - 45972342 45989888 17379 exon_intron ghi_circ_000403 2 13 0.008386337 0.05510407 2.716046202 3.62E-06 0.000198315 yes Gh_D03G1606 D03 - 45972544 45990320 17293 exon_intron ghi_circ_000413 3 0.333333333 0.015531045 0.001696254 -3.194730882 0.021805275 0.21753943 no Gh_D04G0588 D04 + 10473594 10487863 14270 antisense ghi_circ_000448 7 17.33333333 0.02091734 0.050232849 1.263931698 0.018772922 0.205563491 no Gh_D05G1182 D05 - 10178207 10204978 25232 exon_intron ghi_circ_000449 2 5.666666667 0.00545513 0.015381244 1.49548669 0.048558404 0.350581006 no Gh_D05G1184 D05 - 10178889 10205773 26885 exon_intron ghi_circ_000458 1.333333333 13 0.014014922 0.131947996 3.234933856 9.26E-07 6.08E-05 yes Gh_D05G2085 D05 - 19386725 19393893 7169 antisense ghi_circ_000459 0.333333333 3 0.003639406 0.032508648 3.159048842 0.035438605 0.288864482 no Gh_D05G2086 D05 + 19387269 19394349 6582 exon_intron ghi_circ_000465 4.666666667 1 0.005294133 0.00112345 -2.236459102 0.046023133 0.347554007 no Gh_D05G2355 D05 + 23312271 23378222 65952 exon_intron ghi_circ_000468 1.333333333 9 0.007759301 0.052846873 2.767819517 0.000230653 0.006588639 yes Gh_D05G2355 D05 - 23361943 23374269 12327 antisense ghi_circ_000474 14 7 0.149687653 0.073770488 -1.020839553 0.049615589 0.354320019 no Gh_D05G3257 D05 - 51025910 51032798 6889 intronic ghi_circ_000476 17 0.333333333 0.031245651 0.000609052 -5.680946825 5.05E-12 6.64E-10 yes Gh_D05G3434 D05 - 55821984 55861726 39743 intronic ghi_circ_000477 3.666666667 0 0.006695727 0.001 -2.743240723 0.00217014 0.041934762 yes Gh_D05G3434 D05 + 55823750 55863528 39779 antisense ghi_circ_000478 4.666666667 0 0.008656191 0.001 -3.113732325 0.000188405 0.005626467 yes Gh_D05G3434 D05 - 55823874 55863652 39779 intronic ghi_circ_000479 3.666666667 20 0.003230585 0.017601645 2.445842773 3.37E-08 2.76E-06 yes Gh_D05G3434 D05 - 55849268 55932141 82874 intronic ghi_circ_000480 2.333333333 0 0.027319904 0.001 -4.771880488 0.018047119 0.204430295 no Gh_D05G3434 D05 - 55857348 55863652 6305 intronic ghi_circ_000496 26 12.66666667 0.280457307 0.135273341 -1.05190362 0.003691084 0.060626056 no Gh_D06G0205 D06 + 2029118 2038279 6804 exon_intron ghi_circ_000501 0 3.333333333 0.001 0.009955139 3.315441526 0.001968091 0.039182899 yes Gh_D06G0902 D06 - 17839088 17863713 24437 exon_intron ghi_circ_000518 5.333333333 11.66666667 0.014632472 0.031427677 1.102862069 0.015985702 0.194492713 no Gh_D07G1513 D07 - 27284185 27312383 26924 exon_intron ghi_circ_000520 2 8.333333333 0.018038001 0.074085169 2.038145333 0.001590932 0.036042834 yes Gh_D08G0020 D08 - 218535 227168 8212 exon_intron ghi_circ_000523 5.666666667 15 0.07017774 0.188685203 1.426895905 0.003270215 0.056815674 no Gh_D08G0035 D08 + 297955 303838 5884 antisense ghi_circ_000550 0.333333333 5.333333333 0.000431729 0.007010134 4.021242824 0.00170638 0.037369715 yes Gh_D09G0037 D09 + 908438 967439 55289 exon_intron ghi_circ_000551 1.333333333 5 0.225197116 0.847649732 1.912279881 0.025095211 0.232219066 no Gh_D09G0168 D09 + 5408337 5408768 432 intronic ghi_circ_000565 4.666666667 10 0.022917291 0.048828899 1.09129869 0.023345201 0.224030497 no Gh_D09G1575 D09 + 43339191 43354268 14886 exon_intron ghi_circ_000574 2 6.333333333 0.008935127 0.028102286 1.653127362 0.022184386 0.21753943 no Gh_D09G2022 D09 + 47625264 47641677 16414 exon_intron ghi_circ_000575 18 8.333333333 0.07992803 0.036804151 -1.118833025 0.019653896 0.211682121 no Gh_D09G2022 D09 - 47625352 47641765 16414 antisense ghi_circ_000578 22 9.666666667 10.72330569 4.592558441 -1.22337973 0.045399667 0.346832342 no Gh_D10G0257 D10 - 2196692 2196844 153 one_exon ghi_circ_000593 5.666666667 0.333333333 0.005059707 0.000289942 -4.125216169 0.001479426 0.034713679 yes Gh_D10G2262 D10 + 60348469 60431952 83484 exon_intron ghi_circ_000597 0 3.333333333 0.001 0.002642288 1.401787951 0.001968091 0.039182899 yes Gh_D10G2263 D10 + 60426426 60518459 91664 exon_intron ghi_circ_000598 2.666666667 0 0.004472668 0.001 -2.161135723 0.017501813 0.204430295 no Gh_D10G2263 D10 - 60475345 60518865 43521 antisense ghi_circ_000632 4 0.333333333 0.003113759 0.000245584 -3.664367597 0.003513514 0.059189202 no Gh_D11G3106 D11 + 63191911 63286112 94202 antisense ghi_circ_000636 10 4.333333333 0.332756096 0.144916664 -1.199241595 0.044548188 0.344331285 no Gh_D11G3108 D11 - 63458630 63461248 2190 exon_intron ghi_circ_000657 5 14 0.093218491 0.258337866 1.470571051 0.000692259 0.01895059 yes Gh_D12G1051 D12 - 36593978 36597926 3949 exon_intron ghi_circ_000658 14.33333333 45.66666667 0.267980742 0.842167295 1.651977526 4.19E-09 4.59E-07 yes Gh_D12G1051 D12 + 36594059 36598007 3949 antisense ghi_circ_000662 1.333333333 5.333333333 0.035166596 0.14153489 2.008880131 0.021687118 0.21753943 no Gh_D12G2094 D12 - 53959735 53962662 2764 exon_intron ghi_circ_000665 0.333333333 2.666666667 0.003140361 0.025301213 3.010204164 0.040631843 0.317799056 no Gh_D13G0150 D13 - 1411383 1420171 7601 exon_intron ghi_circ_000666 2 0 0.015587329 0.001 -3.962301788 0.031329669 0.270836742 no Gh_D13G0377 D13 + 4050792 4060200 9409 intronic ghi_circ_000678 0 4 0.001 0.071768519 6.165279249 0.004482148 0.066926621 no Gh_D13G1731 D13 - 51840059 51844255 4197 antisense ghi_circ_000682 4.666666667 1.333333333 0.010416629 0.002950967 -1.819628846 0.047272779 0.350581006 no Gh_D13G2157 D13 - 57355067 57388153 32585 exon_intron