Content-Type: text/html; charset=ISO-8859-1 CallMat_Firefox Webmaster Firefox specific output
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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC


Motifs Found
    5UTR Py-rich stretch
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 185 - 10 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels

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+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    A-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
A-box Petroselinum crispum 543 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element
A-box Petroselinum crispum 681 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    ABRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE Arabidopsis thaliana 828 - 6 TACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness

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+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    AE-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AE-box Arabidopsis thaliana 883 + 8 AGAAACTT part of a module for light response
AE-box Arabidopsis thaliana 190 + 8 AGAAACTT part of a module for light response

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+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 949 - 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction
ARE Zea mays 972 + 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    AT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT1-motif Solanum tuberosum 763 - 13 AATTATTTTTTATT part of a light responsive module

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAA
TTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 774 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Hordeum vulgare 456 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 594 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 468 - 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 606 - 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 99 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 98 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    CCGTCC-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CCGTCC-box Arabidopsis thaliana 681 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element related to meristem specific activation
CCGTCC-box Arabidopsis thaliana 543 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element related to meristem specific activation

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 401 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 375 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 278 - 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GC
AACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    G-Box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-Box Pisum sativum 311 + 10 CACACATGGAA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-Box Antirrhinum majus 828 + 6 CACGTA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Zea mays 368 - 6 CACGAC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Arabidopsis thaliana 848 - 10 GCCACGTGGTA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Daucus carota 828 - 6 TACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 851 + 6 CACGTC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    GARE-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GARE-motif Brassica oleracea 229 + 7 AAACAGA gibberellin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Arabidopsis thaliana 570 + 6 GGTTAA light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    I-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
I-box Flaveria trinervia 750 + 7 GATATGG part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    MRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MRE Petroselinum crispum 17 - 7 AACCTAA MYB binding site involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    O2-site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
O2-site Zea mays 747 + 9 GATGATATGG cis-acting regulatory element involved in zein metabolism regulation

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- GCAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    Skn-1_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Skn-1_motif Oryza sativa 277 - 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression
Skn-1_motif Oryza sativa 663 + 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression
Skn-1_motif Oryza sativa 525 + 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression
Skn-1_motif Oryza sativa 145 + 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


+ ACCAACAACA GCACAACGAA ACGGAGGAAT TGAAAAGCTA CAGACCCAAC ACGAAGCGCC TAGACCTTTT 


+ AGAAGTCATT TTTATTTTTC AGGTGCGGCG TCTATGCTTT TTCGAGAGAA GAAACTTAAA GACGCAAACG 


+ GGAAAAAGAA AAGAGACAAA ACAGAGAAAA TCCTCTCTCT ACTCACTACC ACTACTACTA CGACCTATGA 


+ CGTTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


+ CTGAGAGTGT TACTGGCGTC GTGGCGTCAG TCACCGTCGA CCGGATTCGT CGTCAGTGTG AACGAAAAAG 


+ AAAAAAGAGA AATTAGAAAA AAAAAAAAGG GACGACAATG GACGTCTATT GCCCTTTCTC TTTCCCCCAC 


+ CGTGATCGTA AAGGGTAAAA CGGTGCACCG CGCTGTCATT CATCAACTCT AACCGTCCTA TACTAACCTC 


+ CTTTTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


+ TGATCGTAAA GGGTAAAACG GTGCACCGCG CTGTCATTCA TCAACTCTAA CCGTCCTATA CTAACCTCCT 


+ TTTTGTTGGT GTGCGAGGAC GCTCAGCATG GGTATTAGTT AAAAGGGGTG ATATGGGGAT ATAATAAAAA 


+ ATTATTAATA AAATTAAAAA CTCTATTTTA TTTACGAATG TAATTATACG GCACACGCAC GTAGACACAC 


+ CTTCCGTTAC CACGTCGCGT GCATCCTGGT ACTGGGTAAT TTAGAAACTT TCTCTGTTCA TTTACATAAA 


+ TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
- TGATTAAAAT CACCCAAATC CAACAAGCAA AAAAAGAGGA ACTCTTTATG TCCTATCTGT TTCGTTCTCG 


- TGGTTGTTGT CGTGTTGCTT TGCCTCCTTA ACTTTTCGAT GTCTGGGTTG TGCTTCGCGG ATCTGGAAAA 


- TCTTCAGTAA AAATAAAAAG TCCACGCCGC AGATACGAAA AAGCTCTCTT CTTTGAATTT CTGCGTTTGC 


- CCTTTTTCTT TTCTCTGTTT TGTCTCTTTT AGGAGAGAGA TGAGTGATGG TGATGATGAT GCTGGATACT 


- G
CAACGTGAT TGGNGGCTGA TGGCGGCCTG GTCTGTACCT TTTATGTGAT TTGACTCTTC TGTCCCCGAC 


- GACTCTCACA ATGACCGCAG CACCGCAGTC AGTGGCAGCT GGCCTAAGCA GCAGTCACAC TTGCTTTTTC 


- TTTTTTCTCT TTAATCTTTT TTTTTTTTCC CTGCTGTTAC CTGCAGATAA CGGGAAAGAG AAAGGGGGTG 


- GCACTAGCAT TTCCCATTTT GCCACGTGGC GCGACAGTAA GTAGTTGAGA TTGGCAGGAT ATGATTGGAG 


- GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


- ACTAGCATTT CCCATTTTGC CACGTGGCGC GACAGTAAGT AGTTGAGATT GGCAGGATAT GATTGGAGGA 


- AAAACAACCA CACGCTCCTG CGAGTCGTAC CCATAATCAA TTTTCCCCAC TATACCCCTA TATTATTTTT 


- TAATAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


- GAAGGCAATG GTGCAGCGCA CGTAGGACCA TGACCCATTA AATCTTTGAA AGAGACAAGT AAATGTATTT 


- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Lycopersicon esculentum 796 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 762 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 759 + 7 ATATAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 687 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 740 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 785 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 776 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 733 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 765 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 573 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 150 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 549 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 947 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 903 + 8 TACATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 914 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 913 - 9 tcTATATAtt core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 779 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 760 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 644 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 506 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 6 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 815 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 137 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 773 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 814 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 917 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 915 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 813 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


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TAAATATATA CAACCGTTTC AGTTCCCTTG TGTAATTAAA ACCATTCAGG AAAGTTAATT TTGGTTTG
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GAAAAACAAC CAATTTTTTT TTTTTCCCCT TCTGTTACCT GCAGATAACG GGAAAGAGAA AGAGGGTGGC 


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TAA
TAATTAT TTTAATTTTT GAGATAAAAT AAATGCTTAC ATTAATATGC CGTGTGCGTG CATCTGTGTG 


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    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 278 + 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 375 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 401 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
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+ CG
TTGCACTA ACCNCCGACT ACCGCCGGAC CAGACATGGA AAATACACTA AACTGAGAAG ACAGGGGCTG 


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    Unnamed__1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__1 Zea mays 370 + 5 CGTGG
Unnamed__1 Zea mays 850 - 5 CGTGG

> 2018/04/13 10:10:12
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    Unnamed__3
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__3 Zea mays 850 - 5 CGTGG
Unnamed__3 Zea mays 370 + 5 CGTGG

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


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    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 93 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 696 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 36 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 558 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 622 + 4 CTCC

> 2018/04/13 10:10:12
+ ACTAATTTTA GTGGGTTTAG GTTGTTCGTT TTTTTCTCCT TGAGAAATAC AGGATAGACA AAGCAAGAGC 


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+ CTT
TTTGTTG GTTAAAAAAA AAAAAGGGGA AGACAATGGA CGTCTATTGC CCTTTCTCTT TCTCCCACCG 


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- ATTTATATAT GTTGGCAAAG TCAAGGGAAC ACATTAATTT TGGTAAGTCC TTTCAATTAA AACCAAAC