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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


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+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


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+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


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+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


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- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


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- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


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- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG


Motifs Found
    5UTR Py-rich stretch
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1382 - 10 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1342 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1477 - 10 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1340 + 14 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 854 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1337 + 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1316 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 846 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 852 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1338 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 850 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1310 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 848 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 842 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 844 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 840 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 838 - 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


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+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


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+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


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+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CT
CAC
TTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


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- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAAAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    A-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
A-box Petroselinum crispum 1135 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


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+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


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+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


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+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


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- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


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- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


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- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


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- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 940 + 7 GAAAGAA

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


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+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


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- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


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- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    ABRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE Arabidopsis thaliana 276 - 6 TACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness
ABRE Arabidopsis thaliana 1025 - 6 CACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- T
GCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 61 + 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    AT-rich element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT-rich element Glycine max 389 - 10 ATAGAAATCAA binding site of AT-rich DNA binding protein (ATBP-1)

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    ATC-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ATC-motif Spinacia oleracea 765 + 8 AGTAATCT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CT
TCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 179 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 1121 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Box III
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box III Pisum sativum 1282 + 9 CATTTACACT protein binding site

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Brassica rapa 1178 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 1226 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 1119 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 784 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 989 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 835 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 684 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 401 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 400 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 785 - 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 338 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 427 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 339 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 104 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 244 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 226 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 80 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGGGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    CCGTCC-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CCGTCC-box Arabidopsis thaliana 1135 + 6 CCGTCC cis-acting regulatory element related to meristem specific activation

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 599 - 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 1001 - 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 613 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    G-Box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-Box Antirrhinum majus 276 + 6 CACGTA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-Box Pisum sativum 1025 - 6 CACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ A
CGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Arabidopsis thaliana 1025 - 6 CACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Brassica napus 1024 - 7 CACGTGG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Arabidopsis thaliana 26 + 9 GCCACGTGGA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Solanum tuberosum 1162 + 7 CACATGG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Daucus carota 276 - 6 TACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 544 + 9 GACATGTGGT cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGC


- TGCTC
TGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    GAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GAG-motif Arabidopsis thaliana 141 - 7 AGAGAGT part of a light responsive element
GAG-motif Arabidopsis thaliana 863 + 7 AGAGAGT part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    GARE-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GARE-motif Brassica oleracea 1195 - 7 AAACAGA gibberellin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    GC-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GC-motif Zea mays 27 + 8 CCACGGGG enhancer-like element involved in anoxic specific inducibility

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Arabidopsis thaliana 1169 - 6 GGTTAA light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 1167 + 6 GGTTAA light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    HSE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
HSE Brassica oleracea 422 + 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 1491 + 9 AGAAAATTCG cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 943 + 9 AGAAAATTCG cis-acting element involved in heat stress responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTCG 
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Sp1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Sp1 Oryza sativa 1105 + 6 GGGCGG light responsive element
Sp1 Zea mays 561 - 5 CC(G/A)CCC light responsive element
Sp1 Zea mays 1093 - 5.5 CC(G/A)CCC light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Lycopersicon esculentum 1402 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 956 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 879 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 698 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 671 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 487 + 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 376 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 485 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 230 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Daucus carota 483 - 8 TATAAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 452 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 714 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 713 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 374 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 373 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 371 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 178 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 172 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 716 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 486 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 420 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 412 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 697 - 8 TATAAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 706 - 11 TATAAATATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 175 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 705 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 166 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 163 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 700 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 699 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1213 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1209 + 8 TATTTAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1199 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 453 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 912 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 905 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 606 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 531 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 454 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 164 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 162 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 133 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 127 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1368 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 418 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 397 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 396 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 708 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 167 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 965 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 921 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1086 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 129 - 9 TAAAAATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 169 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 920 - 9 ccTATAAAaa core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Ac 484 - 7 TATAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 701 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 704 - 8 TATAAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1365 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 436 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 165 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 489 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 395 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 394 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 712 - 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 391 - 9 taTATAAAtc core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 529 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Ac 455 + 7 TATAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 707 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTAT


AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACA


- GG
AACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTC


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    TCA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA-element Nicotiana tabacum 665 + 9 CCATCTTTTT cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness
TCA-element Brassica oleracea 1478 + 9 GAGAAGAATA cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    TCCC-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCCC-motif Spinacia oleracea 1352 + 7 TCTCCCT part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 1001 + 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 613 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 599 + 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Unnamed__1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__1 Zea mays 50 + 5 CGTGG
Unnamed__1 Zea mays 193 + 5 CGTGG
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> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


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+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


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- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


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- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


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- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Unnamed__3
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__3 Zea mays 27 - 5 CGTGG
Unnamed__3 Zea mays 193 + 5 CGTGG
Unnamed__3 Zea mays 50 + 5 CGTGG
Unnamed__3 Zea mays 1024 - 5 CGTGG

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


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- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1470 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1419 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 982 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 979 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 287 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1115 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1353 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 565 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 591 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1416 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 23 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 343 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 572 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 562 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 744 - 4 CTCC

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TA
ATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCTCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATA


- CTC
TTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    box II
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
box II Petroselinum hortense 26 - 9 TCCACGTGGC part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG
    circadian
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
circadian Lycopersicon esculentum 890 - 6 CAANNNNATC cis-acting regulatory element involved in circadian control

> 2018/04/13 10:10:12
+ CGGCTGTCCC ACATCGAGCT CTGGAGCCAC GGGGACCAGG ACCGTGTATC GTGGCAAAGG TGGTTTCACG 


+ AAAAGGATGC AATAATTCTG ATAGATCTTC ACACAATTTC TTTTTTTTTT TCTAATTTTT ATTTTTATTT 


+ ACTCTCTGAT GTAAATAAAT TTATTATATA TTATTATTAT TAATTTTTTT TGCGTGGGAA GGAAGTTGTA 


+ CCTTGGGGTG ACCATATTGT AAAAAGGTGT GTGCAATGAT AACAAGAAGA GACATACACA CATCACACGT 


+ ACGAGACTCC CTTTGCTTCA TCATTCTGGG TAACTTGTTC ATCATGTCAC GATCATCCCA ATCTCCCGAT 


+ TTATTTTTCC ATGCATTATG TAATATATAC GCAACGTTTT GATTTTTATA ATTGTATCAT TTTTTAGTTT 


+ AAAAAAATTT GTAAATAATA TTTAATCTAT TTTTTATAAA TTATTTTGAT TAAGTCCAAA ATTATTTATA 


+ AAAGTAATGC AAAGTTAAAT GAATTCAGAA ATCGGAAATT TAAAAAAGAG AGGGAAATGT GGTGTGAAGA 


+ GGGAGGAGAG TGGAGGCTTG TCGGGCAAGG GGAGTGGGTG ACGCGTAATA CGCGTCAGCC TAAGCGAGCC 


+ TTATGGTGTA GGCTGAAGCT TCTTTAACTT TACCCCATTT TTTTATTTTC ATAATTTGTT AGTTTAATTT 


+ TATATTTTAT ATTTTTAAAA AGAAAAAAAA CTTAATTTAA CGGGGAGACC TTTGTCTGCA GGAAAGTAAT 


+ CTTCTAGTTA CTGAATTGCC CCTGAAGAGG ATGATAGAGT GAGGGGCATT TAGGTAAATT CATGATTGAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG TTTTGATGTA AAACAAAAAG ATAATTTTGG GGTTTAAAAG 


+ TTAAAAAGGT TTTTAAAGGC AAAAGCTGCG AAAGAAAATT AGAAATAAAA AAATTAAAAA AAAAACAAGG 


+ AGGAGAAGCA ATCACATGCC TGACGACCCA AACGTTCTGC AGCCCACGTG TAGGTTTGGG CCCCACTGTG 


+ GACGCGCCAC CGGCTAAACT GGTCGACATG CCGCGTAATA AAGGGTGGAC CCGAGGGCGG TCCTGGAGCA 


+ ATTAATGCAC AACGCCGTCC TCTAGTCACC CTCATACCGT ACACATGGTT AACCGGCATT TGCCAGTCAA 


+ CTCTTCTGTT TTATTTTCTA TTTAAAATAA TTTATCAAAT GGGAAACGTC CCAAAACAAG CTGTTTTCCA 


+ AAAACCCAAA CACAAAAAGC CCATTCACAC TCGAAGCAAC CAAACACTAT TTCTCTTTCT CTCTCTGTCT 


+ CTCACTTTTT TTCTCTCTCT CTCTCCCTCT CTTGTAATAA AAAGTGCGAG AAGAGAAGAA ATGAGAGAGG 


+ GTTTTATGAA ATGAAGGAGG AGATCATTAT GTAGTACATG TGCTCGCGTT GGTGATCAGA GATTTCTATG 


+ GAGAAGAGAG AAGAAAAGAG AGAGAATTC
- GCCGACAGGG TGTAGCTCGA GACCTCGGTG CCCCTGGTCC TGGCACATAG CACCGTTTCC ACCAAAGTGC 


- TTTTCCTACG TTATTAAGAC TATCTAGAAG TGTGTTAAAG AAAAAAAAAA AGATTAAAAA TAAAAATAAA 


- TGAGAGACTA CATTTATTTA AATAATATAT AATAATAATA ATTAAAAAAA ACGCACCCTT CCTTCAACAT 


- GGAACCCCAC TGGTATAACA TTTTTCCACA CACGTTACTA TTGTTCTTCT CTGTATGTGT GTAGTGTGCA 


- TGCTCTGAGG GAAACGAAGT AGTAAGACCC ATTGAACAAG TAGTACAGTG CTAGTAGGGT TAGAGGGCTA 


- AATAAAAAGG TACGTAATAC ATTATATATG CGTTGCAAAA CTAAAAATAT TAACATAGTA AAAAATCAAA 


- TTTTTTTAAA CATTTATTAT AAATTAGATA AAAAATATTT AATAAAACTA ATTCAGGTTT TAATAAATAT 


- TTTCATTACG TTTCAATTTA CTTAAGTCTT TAGCCTTTAA ATTTTTTCTC TCCCTTTACA CCACACTTCT 


- CCCTCCTCTC ACCTCCGAAC AGCCCGTTCC CCTCACCCAC TGCGCATTAT GCGCAGTCGG ATTCGCTCGG 


- AATACCACAT CCGACTTCGA AGAAATTGAA ATGGGGTAAA AAAATAAAAG TATTAAACAA TCAAATTAAA 


- ATATAAAATA TAAAAATTTT TCTTTTTTTT GAATTAAATT GCCCCTCTGG AAACAGACGT CCTTTCATTA 


- GAAGATCAAT GACTTAACGG GGACTTCTCC TACTATCTCA CTCCCCGTAA ATCCATTTAA GTACTAACTC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC AAAACTACAT TTTGTTTTTC TATTAAAACC CCAAATTTTC 


- AATTTTTCCA AAAATTTCCG TTTTCGACGC TTTCTTTTAA TCTTTATTTT TTTAATTTTT TTTTTGTTCC 


- TCCTCTTCGT TAGTGTACGG ACTGCTGGGT TTGCAAGACG TCGGGTGCAC ATCCAAACCC GGGGTGACAC 


- CTGCGCGGTG GCCGATTTGA CCAGCTGTAC GGCGCATTAT TTCCCACCTG GGCTCCCGCC AGGACCTCGT 


- TAATTACGTG TTGCGGCAGG AGATCAGTGG GAGTATGGCA TGTGTACCAA TTGGCCGTAA ACGGTCAGTT 


- GAGAAGACAA AATAAAAGAT AAATTTTATT AAATAGTTTA CCCTTTGCAG GGTTTTGTTC GACAAAAGGT 


- TTTTGGGTTT GTGTTTTTCG GGTAAGTGTG AGCTTCGTTG GTTTGTGATA AAGAGAAAGA GAGAGACAGA 


- GAGTGAAAAA AAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GAACATTATT TTTCACGCTC TTCTCTTCTT TACTCTCTCC 


- CAAAATACTT TACTTCCTCC TCTAGTAATA CATCATGTAC ACGAGCGCAA CCACTAGTCT CTAAAGATAC 


- CTCTTCTCTC TTCTTTTCTC TCTCTTAAG