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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA


Motifs Found
    5UTR Py-rich stretch
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 153 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 645 - 7 GAAAGAA
AAGAA-motif Avena sativa 543 - 9 gGTAAAGAAA
AAGAA-motif Avena sativa 12 - 7 GAAAGAA

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+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    AE-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AE-box Arabidopsis thaliana 1332 - 8 AGAAACAT part of a module for light response
AE-box Arabidopsis thaliana 83 + 8 AGAAACAA part of a module for light response

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+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 906 - 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

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+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- T
GGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    AT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT1-motif Solanum tuberosum 480 + 14 AATTATTTTTTATT part of a light responsive module

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATT
AATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 477 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 1251 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 939 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 491 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    Box II
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box II Pisum sativum 198 + 11 GTGAGGTAATAT part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATAT


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Glycine max 1134 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 679 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 359 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 284 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1415 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 1112 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1066 - 10 CAACCAACTCC common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 802 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 523 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 407 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 894 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 892 + 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 678 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 51 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 234 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1022 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 360 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 708 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ C
TACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    CAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAT-box Arabidopsis thaliana 619 - 6 GCCACT cis-acting regulatory element related to meristem expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 1456 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 615 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Solanum tuberosum 912 - 7 CACATGG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    GAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GAG-motif Arabidopsis thaliana 151 - 7 AGAGAGT part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    GCN4_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GCN4_motif Oryza sativa 741 - 7 CAAGCCA cis-regulatory element involved in endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Solanum tuberosum 905 - 10 ATGGTGGTTGG light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 534 - 6 GGTTAA light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 547 - 6 GGTTAA light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTA
CACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    HSE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
HSE Brassica oleracea 1268 - 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 1377 + 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 1225 + 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 1266 + 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness
HSE Brassica oleracea 1227 - 9 AAAAAATTTC cis-acting element involved in heat stress responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    MBS
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MBS Arabidopsis thaliana 658 - 6 TAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    MNF1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MNF1 Zea mays 782 + 6.5 GTGCCC(A/T)(A/T) light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    P-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
P-box Oryza sativa 88 - 7 CCTTTTG gibberellin-responsive element
P-box Oryza sativa 776 - 7 CCTTTTG gibberellin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    Skn-1_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Skn-1_motif Oryza sativa 1084 - 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression
Skn-1_motif Oryza sativa 1457 + 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Lycopersicon esculentum 999 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1345 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 1342 - 8 TATAAGAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1311 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1189 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1188 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1165 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1488 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1307 + 8 TATTTAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1275 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 941 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1265 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1461 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1123 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1126 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 923 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 469 - 9 TAAAAATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1120 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 812 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1489 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1108 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1099 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 473 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1325 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1449 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1447 + 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1429 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1233 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1077 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1444 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1445 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1253 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 926 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1446 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 1421 - 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 1309 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1297 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1281 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 476 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 299 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 245 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1346 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 944 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 247 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 986 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1190 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1191 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1319 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 384 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 813 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 246 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1467 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 682 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1162 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 790 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 814 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1278 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1239 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1236 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1368 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1357 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 306 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1094 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1177 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 244 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1464 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1097 + 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 305 - 9 ccTATAAAaa core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 1374 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 342 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1223 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1054 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1422 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 991 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1304 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1211 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Ac 207 + 7 TATAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 1096 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1474 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1155 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 458 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 309 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1354 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 983 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 1187 - 8 TATAAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1405 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 929 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 487 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 662 + 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 307 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1208 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 467 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 308 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1376 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 935 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 1153 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 490 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 938 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1408 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 266 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 206 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 318 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 810 - 9 ccTATAAAaa core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 932 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTT


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAG


+ TTTATTAAAA A
TACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATA
ATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAG


- GATGAA
GGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTG


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- T
GGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATT


TGTAT
TTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    TC-rich repeats
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TC-rich repeats Nicotiana tabacum 328 - 9 ATTTTCTTCA cis-acting element involved in defense and stress responsiveness
TC-rich repeats Nicotiana tabacum 541 + 9 ATTTTCTTCA cis-acting element involved in defense and stress responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    TCA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA-element Brassica oleracea 426 - 9 CAGAAAAGGA cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    TGA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGA-element Brassica oleracea 856 + 6 AACGAC auxin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 1456 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 615 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


+ GAAGCCGATT CTAGAAACAA AAGGAGATCA CTCTTTCTCA AAACAAAGCT ACCCCAAGAA CAAAGCGAAA 


+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


+ AATGAAAAAA AAAAAAAGGG AAGCAATCAC CGGTTTTATA AGAAGTTTGT TGGGTTTTTA ACTCGAGACT 


+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


+ ATTAATCGAG AAATTAACGT ACTATTCAAA GACAAATTTA GGCTTAACCG ATTTTCTTAA CCCACTTTTG 


+ TCCCGTACCG TACTTGGTAC TCGCTCTTCC GAACCAGGCC AGGTAGCCAG CGTCCGTCAG TGGCAGTGCA 


+ CCTGTTCCGC GGTATTCTTT CCCCAACCAG TTACAAAAGT TGAGATGCCA ATAATAAGAG AAAAACCTCC 


+ TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


+ ACAACCAAAA GGTGCCCGTT AATAACACCT GCAATCGCAT GTTTATAGGT GTAAACTGAG AAGACAGACA 


+ TGTAAAGATG TACGCAACGA CTGAGTCGAA AGCGCAGTAG GGTAGATCAA GGGCAATGAG AATTCAAACC 


+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


+ ACTAATAAAA TATTATCGTA AAATAAACGA TAAGTTATTT CATTGCTACT ATTTACGAAT CACACTTTGT 


+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


- CTTCGGCTAA GATCTTTGTT TTCCTCTAGT GAGAAAGAGT TTTGTTTCGA TGGGGTTCTT GTTTCGCTTT 


- TCTTTCTCTC TGAGAGAGAG AGAGAGAACC AGAAAAGGGG TAGGTTTGGC TCCTCTCCAC TCCTTTATAT 


- TTACTTTTTT TTTTTTTCCC TTCGTTAGTG GCCAAAATAT TCTTCAAACA ACCCAAAAAT TGAGCTCTGA 


- TTTGTTAAAT TTGATTAAAA AATAAAAAAT ATCTTCTATA ATTTGTGACT TTTTTTACTT TATTTTAAAA 


- CTAGACATGG TTATACTTCA TAAAAGACAA TTAAAAATTA AAAAAAACAA AAAACAGTTT AAGCCCTAGC 


- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


- AGGGCATGGC ATGAACCATG AGCGAGAAGG CTTGGTCCGG TCCATCGGTC GCAGGCAGTC ACCGTCACGT 


- GGACAAGGCG CCATAAGAAA GGGGTTGGTC AATGTTTTCA ACTCTACGGT TATTATTCTC TTTTTGGAGG 


- ATTAGGCTAA CACGTGTCGT GGGTCGGGCA CCGTCATTTG ACCGAACGTG GCACGTGGGA GCCCATCTCC 


- TGTTGGTTTT CCACGGGCAA TTATTGTGGA CGTTAGCGTA CAAATATCCA CATTTGACTC TTCTGTCTGT 


- ACATTTCTAC ATGCGTTGCT GACTCAGCTT TCGCGTCATC CCATCTAGTT CCCGTTACTC TTAAGTTTGG 


- TGGTACACTC AAAAAATAAT AATAATAATA ATTATTATTA AATTAATCCG TACATAAATA GGCAAGATCG 


- TGATTATTTT ATAATAGCAT TTTATTTGCT ATTCAATAAA GTAACGATGA TAAATGCTTA GTGTGAAACA 


- TTTATAATGA TGATCCCTGA ACCAACATAA TCATACTGAG ATGATTATAT TTTATGTATA ATAAACATCA 


- AAATAATTTT TATGTTAATT GTGTTTTTTA TTAAATTTTT TATTATTTTT AGATGAATTT TATACATAAA 


- ATATTAAATT AGTTCAAATT ATTATTGTTT TTATTTTTTT AAAAAATTAT AATTCAAATT TAATTATTGT 


- TTTTATTTTT TAAAAAAATT ATAATTCAAA TTTAAGATTT TTTATAATAA ATTTTTTAAT TTTAATTTTT 


- TTACAAAGAT AAAGAATATT CAAATTATAA TGACAAAAAA ATCAAATTTT TTAAATGCTT AAAGTGCTTT 


- TTATAAAATT TTACGTTATT AAAAATTTAA AATTAATTCA TAAAAAATAT TTTTAGCAGT AAAATAATTT 


- TGTATTTTTT TCGTTTGAAT ATCTTTTTA
    Unnamed__1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__1 Zea mays 39 + 5 CGTGG
Unnamed__1 Zea mays 728 + 5 CGTGG

> 2018/04/13 10:10:12
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+ AGAAAGAGAG ACTCTCTCTC TCTCTCTTGG TCTTTTCCCC ATCCAAACCG AGGAGAGGTG AGGAAATATA 


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+ AAACAATTTA AACTAATTTT TTATTTTTTA TAGAAGATAT TAAACACTGA AAAAAATGAA ATAAAATTTT 


+ GATCTGTACC AATATGAAGT ATTTTCTGTT AATTTTTAAT TTTTTTTGTT TTTTGTCAAA TTCGGGATCG 


+ CTACTTCCAT TTCTGTCCCT GTATGGGAAA AAAGAAGTAT AATTCTTTTT ATTTTTATTA ATTATTTTTT 


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+ ACCATGTGAG TTTTTTATTA TTATTATTAT TAATAATAAT TTAATTAGGC ATGTATTTAT CCGTTCTAGC 


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+ AAATATTACT ACTAGGGACT TGGTTGTATT AGTATGACTC TACTAATATA AAATACATAT TATTTGTAGT 


+ TTTATTAAAA ATACAATTAA CACAAAAAAT AATTTAAAAA ATAATAAAAA TCTACTTAAA ATATGTATTT 


+ TATAATTTAA TCAAGTTTAA TAATAACAAA AATAAAAAAA TTTTTTAATA TTAAGTTTAA ATTAATAACA 


+ AAAATAAAAA ATTTTTTTAA TATTAAGTTT AAATTCTAAA AAATATTATT TAAAAAATTA AAATTAAAAA 


+ AATGTTTCTA TTTCTTATAA GTTTAATATT ACTGTTTTTT TAGTTTAAAA AATTTACGAA TTTCACGAAA 


+ AATATTTTAA AATGCAATAA TTTTTAAATT TTAATTAAGT ATTTTTTATA AAAATCGTCA TTTTATTAAA 


+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


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- GATGAAGGTA AAGACAGGGA CATACCCTTT TTTCTTCATA TTAAGAAAAA TAAAAATAAT TAATAAAAAA 


- TAATTAGCTC TTTAATTGCA TGATAAGTTT CTGTTTAAAT CCGAATTGGC TAAAAGAATT GGGTGAAAAC 


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    Unnamed__3
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__3 Zea mays 39 + 5 CGTGG
Unnamed__3 Zea mays 728 + 5 CGTGG

> 2018/04/13 10:10:12
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    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 192 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 93 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 697 + 4 CTCC

> 2018/04/13 10:10:12
+ GCTTCTTATG ATTCTTTCTT CTTCTTTACT TAGCCTTTCG TGGCTACTTT CAATCTTTCT CTAATCTCTC 


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TAATCCGATT GTGCACAGCA CCCAGCCCGT GGCAGTAAAC TGGCTTGCAC CGTGCACCCT CGGGTAGAGG 


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+ ACATAAAAAA AGCAAACTTA TAGAAAAAT
- CGAAGAATAC TAAGAAAGAA GAAGAAATGA ATCGGAAAGC ACCGATGAAA GTTAGAAAGA GATTAGAGAG 


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