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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG


Motifs Found
    3-AF1 binding site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
3-AF1 binding site Solanum tuberosum 133 + 10 AAGAGATATTT light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTT
TTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


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- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 268 - 7 GAAAGAA

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+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    ACE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ACE Petroselinum crispum 353 + 9 AAAACGTTTA cis-acting element involved in light responsiveness

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+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    AE-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AE-box Arabidopsis thaliana 264 - 8 AGAAACAT part of a module for light response

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+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 996 + 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    ATCT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ATCT-motif Arabidopsis thaliana 1256 + 9 AATCTAATCT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCT
CTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 401 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    Box III
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box III Pisum sativum 460 - 11 atCATTTTCACt protein binding site

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Arabidopsis thaliana 5 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 80 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 90 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 202 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 206 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 220 + 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 222 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 304 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Petunia hybrida 366 - 7 TGCCAAC common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 397 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 538 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 589 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 596 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 603 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 604 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica juncea 637 - 9 TGCAAATCT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 639 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 664 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 665 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 681 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 682 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 686 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 725 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 726 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 833 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 947 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 1089 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1255 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1296 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 1474 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1475 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAAC


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    CAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAT-box Arabidopsis thaliana 1335 - 6 GCCACT cis-acting regulatory element related to meristem expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    CATT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CATT-motif Zea mays 1108 - 6 GCATTC part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Solanum tuberosum 126 - 7 CACATGG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    GAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GAG-motif Arabidopsis thaliana 503 + 7 AGAGAGT part of a light responsive element
GAG-motif Hordeum vulgare 1046 - 7 GGAGATG part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GG
TCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    GARE-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GARE-motif Brassica oleracea 873 - 7 AAACAGA gibberellin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    GCN4_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GCN4_motif Oryza sativa 1448 - 7 TGTGTCA cis-regulatory element involved in endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    MBS
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MBS Arabidopsis thaliana 1311 - 6 CAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility
MBS Arabidopsis thaliana 1480 - 6 TAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility
MBS Arabidopsis thaliana 1420 - 6 CAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    MRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MRE Petroselinum crispum 814 + 7 AACCTAA MYB binding site involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    O2-site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
O2-site Zea mays 1040 - 9 GATGACATGG cis-acting regulatory element involved in zein metabolism regulation

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAG


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    Skn-1_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Skn-1_motif Oryza sativa 187 + 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression
Skn-1_motif Oryza sativa 695 - 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTG


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Arabidopsis thaliana 37 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 12 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 36 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 48 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 73 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 76 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 349 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 385 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 403 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 654 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 702 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 703 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 704 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 739 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 740 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 922 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 936 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1132 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1161 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1241 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1242 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1243 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1245 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 1257 + 7 ATATAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1258 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1391 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1415 + 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 1471 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AAT
CTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTT
TTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- T
TAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    TCA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA-element Brassica oleracea 308 + 9 GAGAAGAATA cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness
TCA-element Brassica oleracea 1459 - 9 TCAGAAGAGG cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    Unnamed__2
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__2 Petroselinum hortense 814 + 9 AACCTAACCT

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 319 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 616 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 450 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1316 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 363 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1049 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 493 + 4 CTCC

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CC
AGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATCTCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAACACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAACCG TCAATTACAA AGGAAACTG
    circadian
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
circadian Lycopersicon esculentum 137 - 6 CAANNNNATC cis-acting regulatory element involved in circadian control
circadian Lycopersicon esculentum 1469 - 6 CAANNNNATC cis-acting regulatory element involved in circadian control
circadian Lycopersicon esculentum 289 - 9 CAAAGATATC cis-acting regulatory element involved in circadian control
circadian Lycopersicon esculentum 285 + 9 CAAAGATATC cis-acting regulatory element involved in circadian control
circadian Lycopersicon esculentum 1255 + 6 CAANNNNATC cis-acting regulatory element involved in circadian control

> 2018/04/13 10:10:12
+ AATCATTGGG GTAAAATTTC AGTAAGGTTT GGTGGTTATA TGAAGTCTTT TAGTGTATGC TCAGAAAGGA 


+ ATTATTATTA TTTGTACTTC AATTTCAGTT TCATGATTTA GAGGTTCAGA TTCTTCCATG TGAAGAGATA 


+ CTTTTGTGCT ACTTCTTGTA AGTTGGGAAT CATGGATTTC ATTCGGGTCA TGAATTCTAC ACAATATTGC 


+ TCTTTCTGAG GCAATGGTTG AAAATAATCC ATCTAGTAAT TTCTTGCTGG TAAATGTTTC TTTCAAGAAG 


+ TTAGCAAAGT TATCTTTGTT CTTATTGAAG AAGAATATGG AGAGCTACCA AGAAGTATTT CTGCAACTTA 


+ AAAAAACATT TAGGAGTTGG CATGGATGGT AATGTAATAT TCGGTTATTG ATTAATAGGG CGTAAGCGAT 


+ AGTTCCCTGC TGGTGATGAG TGAACTGGGG GAGTAACCAA GTGAAAGTGA TAGAGGGGTC TATCTTGCAG 


+ CTCTCCTTTG ATAGAGAGTT AGTCTGTGAT GTGGTAGAAG TCTGAAGATT GTGCAGCTAT GATTTCTCTG 


+ CATTATTCTA AATAGTGAGT TATGCAACCA AATTTCAATC TTAATTGAAG CATACGGAGT TCTGGGGTTT 


+ CTCTAGAGAT TTGCATTTCT AAATTTTATG GCGAATTGGC TAGTTCTCTT AATTGCAATC TTTGATGACA 


+ GTTTATAGAC CAGTAGATTA TGAAAATTGC TTATGATCTT ATAAGGCAGC TTGAACTGTA TTCAAAATGG 


+ CAAGTACTAG TTGAAAAAAG AGCAGCCCCA GTGAAGGTTT ACAAACCTAA ACTGTAACCA GTATTTGGGC 


+ GAGAAGTACA AGGTCTCTGT GGGCAGGACG TTTCTGTTTG CATAAATCAA ACCTTTACCT CAGCTCATGA 


+ TTCCACATTC ATATTACATA TCTTCTATAA CAGTGACAAA TAAGATACCA GTGCATGAGA GCTTCTTGAG 


+ CTAGCTGAAG CAGACTGGTT TGAAGCTTCT TCTTTGCCAT ATTCTGCATA TTCATCTGTC CATTTCATCT 


+ CCAGGTTTAG TTCATGTTTG ATAGGTCTTG CGTTGTATCA ATTTCTGTGA GATGAACGAA TGCAAGATAC 


+ TTCCCAAAAT TTAAAAGTTA CAGCACATTT AGCACAGGTG TATTACAAAC TCTTTAGGGG CTACAGTTTC 


+ CTCTGTGATA TGATGCATGA GCCTTCACTT TCTTAAATTT ACTTTTCAAG TTTATATTAT TCATCAATAT 


+ AATC
TCTGCA AAATACAGGT TTTTGATAAG TTACCATTGA GCTTGTTGCA CAGTTGGAGT CAACAACAAG 


+ AAGAAGTGGC TTTCCTAGAA TATGCTAACT CTGTCGGGCT TCCCTTCCTA ACAACTAATT TATTACTGTC 


+ CTGTGTTGAG GGCATAATAC AGTTGTGGTT CCCTCTTGTC CTTGCACTGA CACACTGTCC TCTACTGAGA 


+ TAAAATTGGC AGTTAATGTT TCCTTTGAC
- TTAGTAACCC CATTTTAAAG TCATTCCAAA CCACCAATAT ACTTCAGAAA ATCACATACG AGTCTTTCCT 


- TAATAATAAT AAACATGAAG TTAAAGTCAA AGTACTAAAT CTCCAAGTCT AAGAAGGTAC ACTTCTCTAT 


- GAAAAC
ACGA TGAAGAACAT TCAACCCTTA GTACCTAAAG TAAGCCCAGT ACTTAAGATG TGTTATAACG 


- AGAAAGACTC CGTTACCAAC TTTTATTAGG TAGATCATTA AAGAACGACC ATTTACAAAG AAAGTTCTTC 


- AATCGTTTCA ATAGAAACAA GAATAACTTC TTCTTATACC TCTCGATGGT TCTTCATAAA GACGTTGAAT 


- TTTTTTGTAA ATCCTCAACC GTACCTACCA TTACATTATA AGCCAATAAC TAATTATCCC GCATTCGCTA 


- TCAAGGGACG ACCACTACTC ACTTGACCCC CTCATTGGTT CACTTTCACT ATCTCCCCAG ATAGAACGTC 


- GAGAGGAAAC TATCTCTCAA TCAGACACTA CACCATCTTC AGACTTCTAA CACGTCGATA CTAAAGAGAC 


- GTAATAAGAT TTATCACTCA ATACGTTGGT TTAAAGTTAG AATTAACTTC GTATGCCTCA AGACCCCAAA 


- GAGATCTCTA AACGTAAAGA TTTAAAATAC CGCTTAACCG ATCAAGAGAA TTAACGTTAG AAACTACTGT 


- CAAATATCTG GTCATCTAAT ACTTTTAACG AATACTAGAA TATTCCGTCG AACTTGACAT AAGTTTTACC 


- GTTCATGATC AACTTTTTTC TCGTCGGGGT CACTTCCAAA TGTTTGGATT TGACATTGGT CATAAACCCG 


- CTCTTCATGT TCCAGAGACA CCCGTCCTGC AAAGACAAAC GTATTTAGTT TGGAAATGGA GTCGAGTACT 


- AAGGTGTAAG TATAATGTAT AGAAGATATT GTCACTGTTT ATTCTATGGT CACGTACTCT CGAAGAACTC 


- GATCGACTTC GTCTGACCAA ACTTCGAAGA AGAAACGGTA TAAGACGTAT AAGTAGACAG GTAAAGTAGA 


- GGTCCAAATC AAGTACAAAC TATCCAGAAC GCAACATAGT TAAAGACACT CTACTTGCTT ACGTTCTATG 


- AAGGGTTTTA AATTTTCAAT GTCGTGTAAA TCGTGTCCAC ATAATGTTTG AGAAATCCCC GATGTCAAAG 


- GAGACACTAT ACTACGTACT CGGAAGTGAA AGAATTTAAA TGAAAAGTTC AAATATAATA AGTAGTTATA 


- TTAGAGACGT TTTATGTCCA AAAACTATTC AATGGTAACT CGAACAACGT GTCAACCTCA GTTGTTGTTC 


- TTCTTCACCG AAAGGATCTT ATACGATTGA GACAGCCCGA AGGGAAGGAT TGTTGATTAA ATAATGACAG 


- GACACAACTC CCGTATTATG TCAACACCAA GGGAGAACAG GAACGTGACT GTGTGACAGG AGATGACTCT 


- ATTTTAAC
CG TCAATTACAA AGGAAACTG