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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC


Motifs Found
    5UTR Py-rich stretch
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1435 + 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1234 + 13 TTTCTCTCTCTCTC cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1225 + 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 401 + 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1130 - 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels
5UTR Py-rich stretch Lycopersicon esculentum 1033 - 9 TTTCTTCTCT cis-acting element conferring high transcription levels

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+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


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+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


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+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


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+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    A-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
A-box Petroselinum crispum 996 - 6 CCGTCC cis-acting regulatory element

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+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 1045 + 8 gGTAAGAA
AAGAA-motif Avena sativa 243 + 7 GAAAGAA
AAGAA-motif Avena sativa 99 + 7 GAAAGAA

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+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AA
GTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 1306 - 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction
ARE Zea mays 104 - 6 TGGTTT cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    Box-W1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box-W1 Petroselinum crispum 362 - 6 TTGACC fungal elicitor responsive element
Box-W1 Petroselinum crispum 870 - 6 TTGACC fungal elicitor responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Hordeum vulgare 936 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 935 - 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Petunia hybrida 911 + 7 TGCCAAC common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 873 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 836 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 835 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 772 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 767 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 766 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 761 - 6 gGCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 696 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 695 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 1402 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1291 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 680 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1253 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1207 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 651 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 1208 + 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 641 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 571 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 557 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 492 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Hordeum vulgare 393 - 4 CAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 329 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Glycine max 274 + 5 CAATT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Brassica rapa 155 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGCACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAAT


+ AGTA
CCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTC
CAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAT-box Arabidopsis thaliana 747 + 6 GCCACT cis-acting regulatory element related to meristem expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CATT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CATT-motif Zea mays 923 - 6 GCATTC part of a light responsive element
CATT-motif Zea mays 57 - 6 GCATTC part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CCGTCC-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CCGTCC-box Arabidopsis thaliana 996 - 6 CCGTCC cis-acting regulatory element related to meristem specific activation

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 271 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    CTAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CTAG-motif Avena sativa 454 - 9 ACTAGCAGAA

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    G-Box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-Box Triticum aestivum 469 + 10 TCCACATGGCA cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Solanum tuberosum 950 - 7 CACATGG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    GAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GAG-motif Spinacia oleracea 1033 + 7 AGAGATG part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    GARE-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GARE-motif Brassica oleracea 708 - 7 AAACAGA gibberellin-responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    GCN4_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GCN4_motif Oryza sativa 1184 - 7 TGTGTCA cis-regulatory element involved in endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Arabidopsis thaliana 862 + 6 GGTTAA light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    I-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
I-box Flaveria trinervia 1201 + 10 cCATATCCAAT part of a light responsive element
I-box Nicotiana plumbaginifolia 205 - 10 CTCTTATGCT part of a light responsive element
I-box Flaveria trinervia 857 + 7 GATATGG part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTC
CTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    LTR
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
LTR Hordeum vulgare 1303 + 6 CCGAAA cis-acting element involved in low-temperature responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    MBS
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MBS Arabidopsis thaliana 416 - 6 TAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility
MBS Arabidopsis thaliana 443 - 6 CAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- T
GAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    O2-site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
O2-site Zea mays 1036 + 9 GATGACATGG cis-acting regulatory element involved in zein metabolism regulation
O2-site Zea mays 854 + 9 GATGACATGG cis-acting regulatory element involved in zein metabolism regulation

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    Skn-1_motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Skn-1_motif Oryza sativa 474 - 5 GTCAT cis-acting regulatory element required for endosperm expression

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Arabidopsis thaliana 966 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Zea mays 535 + 8 TTTAAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 899 - 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 876 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Nicotiana tabacum 823 - 9 tcTATAAAta core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 620 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 537 - 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Daucus carota 1349 + 9 ccTATAAATT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 1018 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1016 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 497 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 1014 - 6 TATACA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 383 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 384 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 382 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Ac 381 - 7 TATAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 277 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1012 + 9 tcTATATAtt core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 967 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Antirrhinum majus 380 - 8 TATAAATT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Lycopersicon esculentum 265 + 5 TTTTA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 189 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 134 - 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 113 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Glycine max 90 - 5 TAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 109 - 9 tcTATATAtt core promoter element around -30 of transcription start

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ A
GTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACC
TA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- AT
GTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    TC-rich repeats
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TC-rich repeats Nicotiana tabacum 811 - 9 ATTTTCTTCA cis-acting element involved in defense and stress responsiveness
TC-rich repeats Nicotiana tabacum 399 + 9 GTTTTCTTAC cis-acting element involved in defense and stress responsiveness
TC-rich repeats Nicotiana tabacum 521 + 9 ATTCTCTAAC cis-acting element involved in defense and stress responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    TCA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA-element Brassica oleracea 1417 - 9 TCAGAAGAGG cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    TCT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCT-motif Arabidopsis thaliana 1046 - 6 TCTTAC part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- T
TCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 271 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    Unnamed__15
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__15 Zea mays 1375 + 10 CCTCTCCCGTC

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1415 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1378 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1347 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1320 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1130 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 776 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 359 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 54 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 214 - 4 CTCC

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCT


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    Unnamed__6
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__6 Zea mays 377 - 10 taTAAATATct

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


- ATGTCTACGA GTTAAGTATC TAAACCGGTG TGACACCCAA GTTTGATTCT AACTGACTTC CTTCGGTTAT 


- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


- AGTTACCTCC GTGTAATCAT CAGTGTCTCT TCCGTCGGAC AATTCTTTTA CCATAAAGAT CTTCGGTTAA 


- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    W box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
W box Arabidopsis thaliana 870 - 6 TTGACC
W box Arabidopsis thaliana 362 - 6 TTGACC

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


- TCAACTGACG TTCAAACAGA AGGGTTGGGT AAATCTAAAA GTAAAAGATA ACCTGTAAGG TAAAGAAGGT 


- CTCCAGATCC TCCAGTTCAA AAACCTTCTT TAAATATTCT AATAACAACA AAAGAAGGGA CCGACGTCAA 


- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


- CTAACTAAAA TCAAGAACAA ATACGAGACT TAAGAGTTTG ACAGAAATTT TTTAAGTAAT CAGTCGTAAA 


- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


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- TTCTAGTAGA CAAAAAGGAC GAATTACCGT GGGTATACTC GTCTGTCGGT GAAAAAGACC TAACGGGTTA 


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- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


- ACGGTTGAAT ACCTTACGTC GGGATTAACT TTATACTCGG GTACACTCGT AGTACAATAT AGTTTCGTGA 


- CCGTCCCCGG TGTTTCCTGC CACTAAGTTC GAGACATATA ATTTGTACTT TTTCTCTACT TTACCCATTC 


- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC
    rbcS-CMA7a
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
rbcS-CMA7a Lemna gibba 1170 + 9 GTCGATAAGG part of a light responsive element

> 2018/04/13 10:10:12
+ CACACACAGT AAACACTGGT GCATTTATGC ACCTCAAGCA CTGAAAGTTT GCTGGAGAAT GCTAGCCTTA 


+ TTCAGTGAGA TGCCTTGTTT ATTAAAGAGA AAGAAACCAA GATATAGATG GCTTCTAACC TCTTTTTGTA 


+ TGAAATGGAT GAAACAAATA GAAATATCGT GCCAAAACAT CCAGGCAGTA TATTTAGATC AGGCAGCATA 


+ AGAGGAGACA GTACATTTTG CCCGCTTTGG TAGAAAGAAC TAGGATCCTG ACTGTTTTAC CGTCAATTTT 


+ AGTTGACTGC AAGTTTGTCT TCCCAACCCA TTTAGATTTT CATTTTCTAT TGGACATTCC ATTTCTTCCA 


+ GAGGTCTAGG AGGTCAAGTT TTTGGAAGAA ATTTATAAGA TTATTGTTGT TTTCTTCCCT GGCTGCAGTT 


+ ACTTGACTTG TTAGGTGGCA GACAGTTGCT TCGTTCTGTT AGTCCACATC CACATGACAT CAAAACTTAG 


+ GATTGATTTT AGTTCTTGTT TATGCTCTGA ATTCTCAAAC TGTCTTTAAA AAATTCATTA GTCAGCATTT 


+ GCTTTTGACT ATTGTTTGCA CTGCTGGCCG CAAGAGGGTT TGTATCTTGA TTATTCGTGT AAAAAGAAAT 


+ TACAGATGCT CAATTCATAG ATTTGGCCAC ACTGTGGGTT CAAACTAAGA TTGACTGAAG GAAGCCAATA 


+ AAGATCATCT GTTTTTCCTG CTTAATGGCA CCCATATGAG CAGACAGCCA CTTTTTCTGG ATTGCCCAAT 


+ TCAATGGAGG CACATTAGTA GTCACAGAGA AGGCAGCCTG TTAAGAAAAT GGTATTTCTA GAAGCCAATT 


+ AGTACCGTTT CCAGATGATA TGGTTAACAG GTCAATAAAA AAAATTATTT AGGACTCTTT TTGTAGTGTC 


+ TGCCAACTTA TGGAATGCAG CCCTAATTGA AATATGAGCC CATGTGAGCA TCATGTTATA TCAAAGCACT 


+ GGCAGGGGCC ACAAAGGACG GTGATTCAAG CTCTGTATAT TAAACATGAA AAAGAGATGA AATGGGTAAG 


+ AAGTCAGCCT AGCCTTGTGG ATAACAGAGG TAGGCTGGCA GGCATGTCTA AGTTCTGATG TAACAACCAA 


+ AGAGGCAAAG GAGAAGAAAG CCAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAGAAAGG TCGAGAAGGC AAGTGACACA 


+ AACCCAAGAC CCAGATCCAA TGTAACAAGT CAACTTCCTT CTCTTTCTCT CTCTGTCACT GACAATCTTC 


+ ACTAACACAC ACAAACACGC CCCGCACCGC ATTGGACAAA CACCGAAACC AGAAACACGC TCCCCATCTG 


+ CGATTCAGTC CCTTCTCTCC TTTAAATTTA CCGTGTTACC CTTCCCTCTC CCCTCTTCAC TGCCCTAATT 


+ ACAAATCTAC TTCTCTCCTC TTTTGACTCT GTTCTCTCTT CTCTCTCATA CTCGCGGTAA GCACGCCAGA 


+ CAACGCGCAC GCACACTTTC TCTTGTCTG
- GTGTGTGTCA TTTGTGACCA CGTAAATACG TGGAGTTCGT GACTTTCAAA CGACCTCTTA CGATCGGAAT 


- AAGTCACTCT ACGGAACAAA TAATTTCTCT TTCTTTGGTT CTATATCTAC CGAAGATTGG AGAAAAACAT 


- ACTTTACCTA CTTTGTTTAT CTTTATAGCA CGGTTTTGTA GGTCCGTCAT ATAAATCTAG TCCGTCGTAT 


- TCTCCTCTGT CATGTAAAAC GGGCGAAACC ATCTTTCTTG ATCCTAGGAC TGACAAAATG GCAGTTAAAA 


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- TGAACTGAAC AATCCACCGT CTGTCAACGA AGCAAGACAA TCAGGTGTAG GTGTACTGTA GTTTTGAATC 


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- CGAAAACTGA TAACAAACGT GACGACCGGC GTTCTCCCAA ACATAGAACT AATAAGCACA TTTTTCTTTA 


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- TCATGGCAAA GGTCTACTAT ACCAATTGTC CAGTTATTTT TTTTAATAAA TCCTGAGAAA AACATCACAG 


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- TTCAGTCGGA TCGGAACACC TATTGTCTCC ATCCGACCGT CCGTACAGAT TCAAGACTAC ATTGTTGGTT 


- TCTCCGTTTC CTCTTCTTTC GGTTTTTCTT TTTTTTCTTT TTTTCTTTCC AGCTCTTCCG TTCACTGTGT 


- TTGGGTTCTG GGTCTAGGTT ACATTGTTCA GTTGAAGGAA GAGAAAGAGA GAGACAGTGA CTGTTAGAAG 


- TGATTGTGTG TGTTTGTGCG GGGCGTGGCG TAACCTGTTT GTGGCTTTGG TCTTTGTGCG AGGGGTAGAC 


- GCTAAGTCAG GGAAGAGAGG AAATTTAAAT GGCACAATGG GAAGGGAGAG GGGAGAAGTG ACGGGATTAA 


- TGTTTAGATG AAGAGAGGAG AAAACTGAGA CAAGAGAGAA GAGAGAGTAT GAGCGCCATT CGTGCGGTCT 


- GTTGCGCGTG CGTGTGAAAG AGAACAGAC