Silicon flow from root to shoot in pepper: A comprehensive in silico analysis reveals a potential linkage between gene expression and hormone signaling that stimulate plant growth and metabolism

Supplemental File SF4. Promoter sequences of the external group of genes used to identify cis-acting elements and motifs involved in phytohormone responses.

Fernando Carlos Gómez-Merino*, Libia Iris Trejo-Téllez, Atonaltzin García-Jiménez, Hugo Fernando Escobar-Sepúlveda, and Sara Monzerrat Ramírez-Olvera



>At1g47128
>NC_003070.9:c17287749-17285750 Arabidopsis thaliana chromosome 1 sequence
ATTCTGTTCGTATAAGAGATTTTAAAATATAAGCTCAAACTGTTTAAGAGTGTAGTCATGTAATCATATA
CATTTGACTGTATATGTACTGTTCCATCCAAAACTTTCTGTCCATGTAATCGTATTTCAACATGTCATGA
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TTTTCTTCTAACATACGGATTTTTTCCTTTCCGAAATTGAACTTTCTAATAAAAAAATTCGGAACAAGTC
ACCATTATTTTAGAAAATTAAAAAGAGTGACGAACGAAAA
>At5g60360
>NC_003076.8:24277660-24279659 Arabidopsis thaliana chromosome 5 sequence
TTTATGGCATATGTCATTATGATCTCCCTCTCCCTCTATATCAACTGGATACATAAACACACATACTAAT
GAACTTCTATAAATATAACATACATAGAATGAAGCTGAAGCATAAACAGCCCAACCAAGTCATATCTTAT
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TCCTTAAATCCGGGTTTTAGTTCAACCACGAGTTTAACTACATAAACGATTTCCGGTCAGCCTGGTCCTG
ACGGGCCACCAATTTTCAAAACATTGACGAAAGCAAGCCC
>At4g16190
>NC_003070.9:c16769685-16767686 Arabidopsis thaliana chromosome 1 sequence
CTGGTGTCAAACACGAGATATAATTGCACATTGAATACAGCTATATCAAAGCATGAATTTTAAAAAATAT
ATTAAGAAAAACAGATACTTTGATTTATTTTTCATCTATATATATTTTTTTTTGTCAACTTTTTCTATCA
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CTATATTTTAAAGGTAAAAATCTTAAAATTTAGTTTGATTGTTTAGCTTATATGTAATTTATAAGATTTG
ACATTTTGCACTTGTTGTCACTAATGTATAACAATGAAAC
>At4g14540
>NC_003076.8:19307227-19309226 Arabidopsis thaliana chromosome 5 sequence
AATCAGCTGTTTGTGTTCAAATCTTTTGGTTGAAATGTTGTCTCAACGAGCTTGCTATGATCTCGAACTG
TGGCCCTGTAACCTGATTTTCCCTGAGGTGTAGACACGGAAACCATTGGTAGAGGAAACAAGTTTGATAG
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AGTTGTCAGAATCTTATCAGTAAACGGACGGTTCATATAAGATCACGTGTCAAGTGAGCAGAAGTCGTGC
GTCCTCTCTTTATATAAGCTCCGGCGACTCCTTCACCACT
>At5g54630
>NC_003071.7:9634346-9636345 Arabidopsis thaliana chromosome 2 sequence
CGTATTGTCATATCCTTCTCTTTGTTTTGATGTGAGCTAACAAAAATCGTATTTAGTCATATGCTTGTCG
TATTGTCCAAAACAGTCTTCTTTTCTCTTTGTTTTATTGATTCTTTGACTGTGTCTATGTGATTAATTCT
TGTATTTGGCTAATAACAGGTTTTATTAAGCAATCTCTAACTTGGCCTTATTTCTATGTATAGTTATTTG
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TAAGCTTCCTTACAAAACAGAAACCTGAAACCATGTTACCTATAACAACGACATGTATTTATTATTATTT
CTCCATTAGATCTAACGACTCAGAATCACTCTCACTTACT
>At5g43060 
>NC_003076.8:c17274296-17272297 Arabidopsis thaliana chromosome 5 sequence
GAAAGATCCACATTACGATCAATGGAGTTTAAAACGATAAGCTAGAAGGGAAGATAATGCGCTTAACTCA
GTAAAGATAATAGACTTGTTATAAGCTTAAATTGCATCGAGTTCTAAGAGTCTAACATAGATTCTTCTCG
GAAAACCGGAGAAAAAAACAAGAAAATATTTTAAATTTATAATTGGTCTTTTCCAAGAGTGAAGAAAGAG
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TGGACGGCTTTAACAAATGTAATTGACTCTTACAAATTTTATTATTTTAATTTTCACCCCACTATTTCTC
ACTTATTTCTTTAATTCCCTCATCTCTTATAATTGACCCC
>At5g45890
>NC_003076.8:18611239-18613238 Arabidopsis thaliana chromosome 5 sequence
TAAAATCGTTGATTGTTAAAATTTAAAATTAGTTTCATTACGTTTCGATAAAAAAATGATTAGTTTATCA
TAGCTTAATTATAGCATTGATTTCTAAATTTGTTTTTTGACCACCCTTTTTTCTCTCTTTGGTGTTTTCT
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TATGCAGTTATTTGTCAATTTTGAATTTAGTATTTTAGACGTTATCACTTCAGCCAAATATGATTTGGAT
TTAAGTCCAAAATGCAATTTCGTACGTATCCCTCTTGTCGTCTAATGATTATTTCAATATTTCTTATATT
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CATTTTTCTTTTTGATTTGATTAAGCTTTTAACTTGCACGAATGGTTCTCTTGTGAATAAACAGAATCTT
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ATGCATGAAAGGTACCTACGTACTACAAGAAAAATAAACATGTACGTAACTACGTATCAGCATGTAAAAG
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TTAAATATTAATTTTAATTAATTAAATAAGGAAATATATTTATGCAAAACATCATCAACACATATCCAAC
TTCGAAAATCTCTATAGTACACAAGTAGAGAAATTAAATTTTACTAGATACAAACTTCCTAATCATCAAA
TATAAATGTTTACAAAACTAATTAAACCCACCACTAAAATTAACTAAAAATCCGAGCAAAGTGAGTGAAC
AAGACTTGATTTCAGGTTGATGTAGGACTAAAATGGCTACGTATCAAACATCAACGATCATTTAGTTATG
TATGAATGAATGTAGTCATTACTTGTAAAACAAAAATGCTTTGATTTGGATCAATCACTTCATGTGAACA
TTAGCAATTACATCAACCTTATTTTCACTATAAAACCCCA
>At4g39090
>NC_003075.7:c18219616-18217617 Arabidopsis thaliana chromosome 4 sequence
TCTCTGTTACTTTATTCGAGAAGAAAATACTGATTGAATGATGGAACTATTATCGGTTGAATTGAGGCTT
TTTTGGAAATTAGATTGTGTTGCTTTAGTGTAGGCATTGATTGTTAATAATTCATTGATTTGTCATCTAA
ATTGGTTTCATGAAGTTGTTTTTGCAAAGAGAAGTAATCAATTGAGTTTAAATTGATTTTTTCTGTTTGC
AGGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCGTATAACCCAGATGACTTGATGGTGCAATGCGAGGAGTGTTCTGAGT
GGTAAGTGTTCACTTATTTGAAACTCTGTTTTAATCTTCTTGAGTCACAATCTGGAATTGCTCGTATGTT
TTTCGTGTATCCATGAGGTCCTAGTTGATATGCTATTGAGGTTGCTTGAGATGAATGCTTTTGTCATGCT
TTACTTCGGTGATGCTCTTCCTTACTCATGTTCATGTTTTGTCTTATCTGATATTGTGGAAACTGCAGAT
GAATAGGAACATAAGCTGATACTCTAGTCTGAACGTTTGTAATATCTGTGATTAACATTCTAATGTATAT
GTTGCGGATTTTCAAATTTTCTTACACGTTACTGATTGAGTCGCTGTTAAGGTTTGGGTTTTTCTGCAGC
TTCTTAGTTTGTGCCTTGGGTCTTTCACCCATGTTAGCTTGCTATATGACACAAGTAACGTAAATGAAGT
CATACTGAAACAAATAGTGATCGTTTGATCTTGGAAGTTGGAACTGTTAAGTGTTAAGCTTAATCTTTTT
ACTTTTTTTTTTGTAAAGAGAGGATTAAGGTTTTTTGTTTCGAATGTCTTTGTCAGTTGCCTTTGATGTT
ACAGCAAACTAACATTGGCTCAGGTTTCATCCTTCTTGTATAGGAACAACAATAGAGGAAGCTAAAAAGC
CAGATAACTTCTACTGCGAAGAGTGTTCCCCACAACAGCAGAATTTGCACAACTCTAATTCAACTTCCAA
TAACAGAGATGCTAAGGTATTTCTCTATTTCTCATTTCAGAAAATATCTTTAGTTTTTGAGGGATGGTCA
AACCCGTTGCAAATAGGCTTGAATAAATTTAAGGTATTTAAGTTGACCGTTCGTTCCACATATAAAGCTA
GCCTTGCCAACAATTGTAAGCTCTTGGACTGATAAAATATACCAACTTAAGGCAGAATAAACACATAAAC
CCAAAGTATATGTGTCATTAAGGTCAAAGACAACCTTGTGAAATGTTTTGTCCTAACTAACAGGTGAATG
GAAAGCGCAGCCTGGAGGTAACTAAATCGAAGAACAAACACACTAAGCGACCAGGTTAACATAAACTTGT
AAAGGCTATAGATATCTGGTTGGTGAGTCTGAGTATCAATCGTGTAATCTACAAAGGTGGTTTTGTTTTC
TTTCCCTCTCTAGTTTTTTCTTTCTTAAAAAATGAGGGTTTAGGTTTGTTGGCTTGATTGTTGTATAATT
TATATGTATAGCGTATGGTGGTTTCTCATCTCCTTTAGTTGTCACATATAAAATTTGGGTAAAATGGTTT
GTTTATAATAAGAAAACAAAACAAACAAACAAACAAAGAGAGTGTTGGTTCCTTATTTGTTTGTTTTCAT
TGTGAACTCTAGAAACCCTTCATTCTTTATTAGTTTTTCATTCTTTATTAATTCTAAAACGCATATTCAA
AGAGACATATTTGATCATCGTGTCTTCATAATTTGGTTCAAAGTACAGCCAAAAACCAGGAGGTACACTA
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GAAACATGGCAACTACCGATCATGAGCTTCTACATTTGTCTCAGAAAAAGAGGAAGATAGAACTATTTTT
TAAAGTTTTTAGAAAAGAGAGAATTAATATTATCCAAGACAACACGGCACTGCTAACAACAAGTTGAACC
TATCCCATTCCATTACTCCATACCCATTCAATGATTAACA
>At3g45310
>NC_003074.8:c16632570-16630571 Arabidopsis thaliana chromosome 3 sequence
TGGGTTTACCTTCCTTGGCAATTACTTCTAGTTCAGTGACTTCATCAGTTTCAGGACCATCAGCCTCTCC
TTCCTCTGCTAACAACTCAATGTTCATTTCTCACACCATTATATATGGTGATGGAAGATGACATTGGACA
ATGTGCTTCACATTTCTTTATTAATGTTTAAACTTTCTATCAGTTCTGTTGTAAACAAGTTTTTATTTAT
GTAACACTCAAGATGTAGCAGAAATGTCTAAATATTTTTTTTGTTTATACATGGTTTTTGTGTCTGTGAT
TAAAAGAGAATAAGGATCATGTTGTAATAACAAATCAGGGCTCTTATGAAAACAGAACCAAAGATAACAA
TGAATATTATTGTCTTTAGAGTAGTGCATAATGAAAGAGAGACAAATAAAAAGCAAAGACTATGACTATA
AGGATCAAGTGGATCCATTTGTGAGCAGTTTAGTCTTATTTCTTCCTTCAATTTCCATGAGCATGCCTAA
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TGTGATCAACAACTTTTTTGGCTATTGTTGGTGACTGAACAATCCACATGAGGTTGTAACCTTTGGTCTT
ATGCAGAAGTATTACGGTCGTGGAGATGAGAAGTTGGATGATCCAAGGTAAGGTAATGAGTACTGTTCCG
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>At1g02300
>NC_003070.9:451107-453106 Arabidopsis thaliana chromosome 1 sequence
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AGAAGAAGATTTAGGGACTAATTTGAGAACACCCTTTGGCAAAGTCTGATGATGATGGCCAGCAGAAACT
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CCCATAAAAAATTACGAACGATGTGTAATGACTAATGACG
>At5g60360
>NC_003076.8:24277660-24279659 Arabidopsis thaliana chromosome 5 sequence
TTTATGGCATATGTCATTATGATCTCCCTCTCCCTCTATATCAACTGGATACATAAACACACATACTAAT
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>At4g11320
>NC_003075.7:6885166-6887165 Arabidopsis thaliana chromosome 4 sequence
GTGAAAAACTCTAGGGGCATTACATGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCTCGAAACATTGCCAATC
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ATTTAAAACTGATTTTTTAATATTGAGCATGTACAAAAAAACACGGAAAAAGATTTTGTGGTGTTCTAGC
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TTACTCATTCACCCAAGCGAACTTTGGGCATGTTTCTATACCCAATCGAAAATATATCGAACAGCCAAAA
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CACTACTCGACACAAATGCATGAGTAGGTTTACCCATTTG