# This file was created Sun Mar 8 23:46:41 2020 # by the following command: # g_mmpbsa -f ../traj3-pbc.xtc -s ../md.tpr -n ../index.ndx -i /home/nforlemu/ligmd/tim/mmpbs_tut/pbsa.mdp -tu ns -b 250 -e 300 -dt 0.16 -pbsa -decomp # # g_mmpbsa is part of G R O M A C S: # # Getting the Right Output Means no Artefacts in Calculating Stuff # @ title "Vacuum MM Energy" @ xaxis label "Time (ns)" @ yaxis label "Energy (kJ/mol)" @TYPE xy @ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85 @ legend on @ legend box on @ legend loctype view @ legend 0.78, 0.8 @ legend length 2 @ s0 legend "Protein VdW Energy" @ s1 legend "Protein Elec. Energy" @ s2 legend "LIG VdW Energy" @ s3 legend "LIG Elec. Energy" @ s4 legend "Protein-LIG VdW Energy" @ s5 legend "Protein-LIG Elec. Energy" @ s6 legend "Protein-LIG Total Energy" 250080.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -109.545 -117.775 -227.319 250240.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -116.751 -128.261 -245.013 250400.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -103.859 -156.267 -260.126 250560.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -106.977 -101.655 -208.632 250720.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -107.282 -131.068 -238.350 250880.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -102.291 -146.190 -248.481 251040.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -116.068 -146.820 -262.888 251200.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -113.277 -133.475 -246.753 251360.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -121.681 -118.386 -240.067 251520.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -112.290 -128.417 -240.707 251680.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -98.041 -127.507 -225.548 251840.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -114.362 -163.111 -277.472 252000.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -127.552 -126.501 -254.052 252160.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -105.654 -171.250 -276.904 252320.000 0.000 0.000 0.000 0.000 -119.715 -123.421 -243.135 252480.000 0.000 0.000 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