BMK211021-AP383-ZX01-0201|西南林业大学10个宏基因组12个代谢组建库测序分析

本页面展示项目结果质控（QC）信息。第一部分是所有质控指标列表，第二部分是每个指标的详细说明和结果展示。

项目信息概况：本项目对12 个样品中的2,400 个代谢物进行了分析。

表达定量指标是指基于表达量结果结合相关性分析检查生物学重复，一般来说生物学重复样本间具有较高的相关性，具体统计结果如下：

表1 表达定量指标

指标名称	评价标准	是否达标
组内相关性最小值	≥0.5	yes

注：组内相关性最小值：计算不同样品间的表达量的皮尔逊相关系数或斯皮尔曼相关系数，同一个生物学重复组内样品的相关性>=0.7时，认为重复性较好。

差异结果指标是对差异分组中的差异代谢物数目的统计，差异数目的多少将影响后续的研究，具体统计结果如下：

表2 差异结果指标

指标名称	评价标准	是否达标
差异数目最大值	≥10	yes

注：差异数目最大值：不同差异分组中差异代谢物数量的最大值。

下面列出一些常见的指标异常的情况、原因和处理方法。

常见问题

样品的检测要持续很长时间，尤其是当样本量很大的时候。在检测过程中实时地监控仪器稳定性、信号是否正常就十分重要。及时发现异常，尽早将问题排除，以保证最终采集数据的质量。由图1可以看到，QC样本BPI出峰保留时间和峰面积都重叠很好，说明仪器稳定性很好。

图1 QC样本BPI重叠图

根据标准品的保留时间与峰型的信息，对每种物质在不同样本中检测到的质谱峰进行校正，以确保定性定量的准确。各样本的TIC图如下文件：

图2 样本TIC图

SampleID	H1	H2	H3	H4	H5	H6	L2	L6	L1	L4	L5	L3
H1	1	0.87	0.78	0.79	0.87	0.91	0.83	0.82	0.8	0.86	0.85	0.77
H2	0.87	1	0.83	0.84	0.85	0.89	0.82	0.83	0.85	0.88	0.87	0.78
H3	0.78	0.83	1	0.85	0.82	0.89	0.82	0.91	0.87	0.86	0.91	0.89
H4	0.79	0.84	0.85	1	0.82	0.89	0.84	0.87	0.84	0.83	0.89	0.82
H5	0.87	0.85	0.82	0.82	1	0.92	0.87	0.86	0.86	0.87	0.89	0.8
H6	0.91	0.89	0.89	0.89	0.92	1	0.88	0.91	0.88	0.91	0.94	0.86
L2	0.83	0.82	0.82	0.84	0.87	0.88	1	0.92	0.86	0.84	0.91	0.8
L6	0.82	0.83	0.91	0.87	0.86	0.91	0.92	1	0.89	0.86	0.97	0.91
L1	0.8	0.85	0.87	0.84	0.86	0.88	0.86	0.89	1	0.83	0.91	0.84
L4	0.86	0.88	0.86	0.83	0.87	0.91	0.84	0.86	0.83	1	0.91	0.81
L5	0.85	0.87	0.91	0.89	0.89	0.94	0.91	0.97	0.91	0.91	1	0.9
L3	0.77	0.78	0.89	0.82	0.8	0.86	0.8	0.91	0.84	0.81	0.9	1

样品相关性结果的完整表格如下：

图3 样品相关性图

group name	All diff	down-regulated	up-regulated
H_vs_L	106	49	57

各分组差异结果的完整表格如下：